Retrovirusai remtis baltymų katalizatorius, vadinami proteazės fermentas, kaip dalis jų reprodukcinio proceso. Inhibitorius, kad baltymų metimų beždžionių veržliaraktį į retrovirusų "mašinų sunaikinimo. Iš tiesų, tokie proteazės inhibitoriai jau naudojamas ŽIV infekcijai gydyti AIDS sergantiems pacientams [Šaltinis: Britannica].
Deja, erzinimas iš tokių baltymų struktūra yra vienas iš sunkiausių galvosūkiai mes žinome. Įsivaizduokite užpildyti milžinišką dėžutė su susivėlęs Kalėdų eglučių žiburiai, nebenaudojamų Subtili žaislai, spygliuota viela, lipnia juosta ir elektromagnetų, tada ją pakratant ir prakeiktas jis aplink, ir pagaliau bando atspėti, ką forma norite padarė. Jūs tik pradėjo subraižyti šią užduotį sudėtingumo paviršiaus. Baltymai gali būti sudarytas iš daugiau nei 10.000 atomų vienetą, formavimo grandines, sub-tinklai ir obligacijas daugybę derinių; Tiesą sakant, yra daugiau būdų nusimesti baltymą, nei yra atomų visatoje [Šaltinis: Bohannon].
Toks sudėtingumas yra daugiau nei net superkompiuteris kartais gali dirbti, ypač todėl, kompiuteriai nėra ypač gerai Dirbant su trijų dimensijų formų. Taigi, mokslininkai pradėjo ieškoti greičiau ir daugiau veiksmingų priemonių užkirsti baltymų struktūras. Jų sprendimas? Naudokite prigimtinę erdvinės analizės gebėjimus žmogaus smegenis. Gimė Foldit. Beveik iš karto, ji pradėjo mokėti dividendus.
Šiame kitame skyriuje, mes atidžiau pažvelgti į tai, kaip Foldit veikia, o kas žaidėjai įvykdęs su juo ir ar jie išgydyti ŽIV.
Molekulinė Clockwork
Esminė laikrodininkas amato sudaro montavimas subtilus dalių per kompaktiškas erdvę kaip įmanoma kolekciją, kartu užtikrinant, kad stora ketvirtadaliai nesikerta su laikrodis anketa funkcija.
Be Foldit, žaidėjai naudoti paprastą dėžutę įrankiai manipuliuoti baltymo formą. Idėja yra sulenkti, pasukti, perkelti ir kratoma baltymo šoninių grandinių aminorūgščių magistralinių toks, kad visa struktūra yra supakuota į savo optimalų formos. Žaidėjai žino, kad jų sprendimas veikia, kai jie atsikratyti susidūrimų tarp šoninių grandinių atomų, paslėpti hidrofobinės grandines viduje baltymų, veido hidrofilinė grandines išorę ir iši