Jefferson tapo prezidentu 1801 Luiziana pirkimas dar nebuvo padaryta, o aplink aukštupį plotas Misūrio ir Kolumbijos upės vis dar neištirta iki baltymus. Šis didžiulis regionas nebuvo dalis Jungtinėse Amerikos Valstijose ir jos statusas buvo neaiškus; jis sakė, kad priklauso Prancūzijoje ar Ispanijoje ar Didžiojoje Britanijoje, arba niekas.
Vienas iš pirmųjų priemonių Jefferson naują administracijos buvo numatyti pakankamai išnagrinėti šiame regione, manoma, kad jie būtų turtingi kailiai, mediena , ir mineralų. Atsižvelgiant 1802-03 žiemą Kongresas sutiko su 2500 $ asignavimo tikslui. Jefferson organizavo kaip karinės ekspedicijos išsiuntimo iš karo departamento šalis.
Meriwether Lewisas, Jefferson privatus sekretorius, buvo įdėti į komandą. Lewisas prašė, kad Williamas Clark senas draugas ir kolega karys, būti bendrai lyderis ekspedicijos. Lewisas buvo suteikta kapitono komisiją ir Clark buvo leitenantas. Lewisas atsisakė pripažinti pagal rangą skirtumą. Clark buvo kreipiamasi "kapitonas" nuo pradžios iki pabaigos ir yra vadinamas "Kapitonas" iki šios dienos.
Lewisas ir Clark buvo vyrai išskirtinio fizinės ir psichinės galimybes, ir gerai dirbo kartu kaip komanda. Abi turėjo ilgametę patirtį dykumos gyvenimo ir upių kelionės. Lewisas buvo natūralus lyderis ir turėjo daugiau mokslinį protą. Clark buvo įgudęs abejotinais su derybų su indėnų genijus.
Įdomūs faktai apie Lewis ir Clark expeditionFor jų vadovavimo, Meriwether Lewis ir Clark William kiekvienas gavo 1600 akrų (650 ha) žemės kaip atlygis. Iš vyrų poilsio gavo dvigubą darbo užmokestį ir 320 akrų (130 ha). Vertėjas Toussaint Charbonneau gavo papildomą $ 533,33 už savo paslaugas. Žmona Sacagawea gavo nothing.The atradėjai pabuvoję kas yra dabar 11 valstybių: Illinois, Missouri, Iowa, Kanzasas, Nebraska, Pietų Dakota, Šiaurės Dakota, Montana, Idaho, Oregonas, o Washington.Sacagawea, tik moteris padaryti raundą Kelionės, pagimdė berniuką, Jean Baptiste, vasaris 11, 1805 Po ekspedi
