Diego de Almagro, artimas Pizarro, buvo gubernatorius Kurių regionas į pietus (Čilė ir Pietų Bolivija). Ieškoti jokių turtus ten ir jausmas apgavo, Almagro konfiskavo Cuzco iš Pizarro pajėgų. Pizarro retook miestą ir įdėti Almagro mirties 1538. 1541 Pizarro buvo užmuštas Almagro pasekėjų. Norėdami nustatyti tam Charles I Ispanija nusiuntė Viceroy, kuris buvo nuverstas per 1548 Gonzalo Pizarro Francisko pusę broliu, kuris jau anksčiau pasiskelbė gubernatorius. Karaliaus institucija buvo įkurta 1548.
vicekaralystė Peru
Dėl savo auksą ir sidabrą, Peru buvo svarbiausias Ispanijos Amerikos kolonijose. Vicekaralystė įtraukti visas Ispanijos, Pietų Amerikoje, taip pat Panama, per kuriuos Peru lobis buvo atliktas būti vežamos į Ispaniją. Indai buvo naudojami kaip kalnakasių, o kartais jie sukilo pagal atšiaurių Ispanijos taisyklė. Po 1571 sukilimo, Viceroy Francisco de Toledo turėjo Tupac Amaru, ilgiausiai išgyvenusio narys Inca karališkos giminės, mirtimi.
Peru turtai pritraukė Buccaneers daugelio tautybių. 1624 Olandijos Rytų Indijos kompanija apgulė Callao penkis mėnesius į nesėkmingo mėginimo imtis Lima. Iki vidurio 17 amžiuje, tačiau Peru kasyklos buvo žaisti iš ir kolonija pradėjo mažėti ekonomiškai ir politiškai.
teritorija į šiaurę buvo atskira vicekaralystė, vadinamas Naujoji Granada, į 1717 1776 formavimosi La Plata vicekaralystė atskiras Peru pietrytinėje dalyje žemyne, įskaitant Upper Peru (Bolivija), kuriame buvo įsikūrusi kasyklos. Kapitonu generalinis Čilė tapo nepriklausoma nuo Peru 1778
Indai buvo engiami ir blogai elgiamasi pagal ispanų. Jie buvo priversti dirbti už mažą darbo užmokestį laukuose, kasyklų ir tekstilės fabrikų ir buvo stipriai apmokestinamos be. 1780 José Condorcanqui, kuris paėmė pavadinimą Tupac Amaru II, vadovaujama nesėkmingą Indijos sukilimą, kuris truko trejus metus.
Nepriklausomybės judėjimas
Pirmieji Nepriklausomybės judėjimus Pietų Amerikoje netrukus atėjo po Ispanija buvo areštuotas Napoleonas Bonapartas iš 1808. Peru pareigūnų liko ištikimi Ispanijos sosto, ir Viceroy buvo greitai siųsti karius į maištingų dėmės kaimyniniuose regionuose, taip pat jo paties.
revoliucinės pajėgos sustiprėjo, tačiau ir 1818 Čilė, su José de San Martín Argentinos pagalbos, laimėjo nepriklausomybę. Į revolutionists pradėjo Peru invaziją 1820 ir Limos be 1821 m San Martin priel