Antrojo pasaulinio karo (1939-1945) nutraukė Menzel akademinę karjerą. Nuo 1942 iki 1945 metų, kaip vadas, jis tarnavo JAV karinio jūrų laivyno ir mokė Kryptologiczne, kuri apima kūrimo ir vertimo pranešimus slaptą kodą. Jis taip pat padarė tyrimus nuo saulės aktyvumo poveikį radijo bangų ryšio ir radijo dauginimui. Karas parodė radijo ryšio vertę ir saulės aktyvumo poveikį jai. Po to, Menzel padėjo JAV oro pajėgų įsteigti observatoriją, tuo Sacramento Peak netoli Alamogordo, Naujoji Meksika.
Menzel toliau būti ypač žavi saulės užtemimas, o jis vadovavo Eclipse ekspediciją į Sibirą 1936 metais jis keliavo pasaulyje, ir matė per keliolika Saulės užtemimai savo gyvenimą.
produktyvus autorius, dirbdami savo daktaro Prinstono jis padėjo palaikyti save rašyti mokslinės fantastikos istorijas. Vėliau gyvenime, jis buvo redakcinio patarėjas įvairių periodinių leidinių, įskaitant Galaxy Žurnalas mokslinės fantastikos žurnale. Nepaisant jo susidomėjimą moksline fantastika, tačiau jis parašė tris knygas nuvainikuoti NSO ir vizitacijos iki nežemiškos būtybės. Jis teigė, tokie reiškiniai buvo viena iš apraiškų įvairių gamtos reiškinių ar optinė iliuzija rezultatas.
Menzel padėjo populiarinti astronomija lauką. Jis parašė keletą knygų, nukreiptos į plačiajai visuomenei, įskaitant laukas vadovas į žvaigždžių ir planetų (1964), populiarios vadovą pradedantiesiems astronomams ir mūsų Saulės (1949), standartinė nuoroda daroma šiuo klausimu.
Kartu su savo akademinės karjeros, Menzel taip pat tarnavo kaip įvairių vyriausybės ir karinių organizacijų konsultantas. Jis buvo glaudžiai susipažinęs su prezidento Johno F. Kennedy, dažnai su juo atitinkantis Kennedy prezidentavimo dėl politinių ir mokslo klausimais įvairovė metu.