1937 Lorenz buvo paskirtas dėstytojas lyginamosios anatomijos ir gyvūnų psichologijos Vienos universitete. Po trejų metų jis paliko Austriją tapti psichologijos profesorius iš Karaliaučiaus universiteto Rytų Prūsijoje (dabar Kaliningrado Sovietų Sąjungoje). Antrasis pasaulinis karas (1939-1945) netrukus nutrūko jo akademinę karjerą. Jis prisijungė prie Vokietijos armijos ir tarnavo Rytų fronte kaip gydytojas. 1944 birželio rusų kareiviai paėmė jį į nelaisvę, ir jis praleido beveik ketverius metus kalėjimo stovyklas.
Jis tęsė studijas Altenberg po susitikimo su nedideliu stipendija iš Makso Planko draugijos mokslo pažangą karo. Jo 1949 knyga, išleista anglų, kaip karaliaus Saliamono žiedas: naują šviesą Gyvūnų būdais (1952) tapo tarptautinės sėkmės ir pristatė sąvokas etologijos daugelio skaitytojų. Jis taip pat rašė populiarus žmogus Meets Dog (1955), kurioje jis tyrinėjo tarp žmonių ir naminių gyvūnų santykius. Jo prieštaringai knygos agresijos (Vokietijos, 1963; Anglų, 19661, jis apibrėžiamas kaip agresijos elgesio nukreipta narių savojo rūšių ir teigė, kad agresija yra įgimtas žmogaus, taip pat gyvūnų
1951, Lorenz. tapo galvos mokslinių tyrimų stoties Makso Planko instituto Jūrų biologija, kas dabar Vestfalija, Vokietija. Be viduryje 1950-aisiais, jis ir kiti du mokslininkai nustatyta elgsenos fiziologijos institutas Seewiesen, Bavarijos, netoli Miuncheno. Lorenz tapo jos vienintelis režisierius po 1961 1973 Lorenz tapo direktorius Lyginamosios etologija Austrijos mokslų akademijos instituto 1973 metais