Po Akademinės atostogos paleisti BIOGEN Gilbert sugrįžo į Harvardo 1985 Jis vėl mokymą ir 1987 buvo paskirtas pirmininkas ląstelių ir vystymosi biologijos katedros. Jis taip pat toliau jo tyrimus genų struktūros ir baltymų iš rekombinantinių organizmų gamybai. Pabaigoje 1980-aisiais, jis tapo žmogaus genomo projektas, kurio tikslas buvo seka ir map visą žmogaus genomą, ar 46 žmogaus chromosomos rėmėjas.
1992 Gilbert įkurta privati įmonė vadinama daugybė Genetika Inc. "Myriad dalyvavo pastangų seka žmogaus genomą. 1996 jis tapo vyriausiasis vykdantysis pareigūnas NET-Genics, farmacijos biotechnologijų bendrovė. 2001, jis paėmė akademines atostogas iš Harvardo prisijungti prie rizikos kapitalo įmonė, vadinama BioVentures investuotojai, remiantis Cambridge, Massachusetts.
Gilbertas buvo suteiktas garbės laipsnių Kolumbijos universitetas, Čikagos universiteto ir Universitetas Rochester. 1991 metais buvo garbės bendradarbis Trinity College, Kembridžo universitetas. Jis yra Nacionalinės mokslų akademijos, American Academy of Arts and Sciences, The American Society of Biologinių chemikai, ir Amerikos fizikų draugijos narys. Jis yra užsienio narys Britanijos Karališkosios draugijos.
Gilbert gavo daugybę apdovanojimų ne tik Nobelio premijos. 1968, jis gavo US Steel fondo apdovanojimą molekulinės biologijos Nacionalinės mokslų akademijos. 1979, su Frederick Sanger, jis gavo Albertas Lasker pagrindinės medicinos tyrimų apdovanojimą. Jis buvo išduotas Naujosios Anglijos Metų verslininko apdovanojimą 1991