Kuveitas invazijos į Iraką, 1990 atvedė į Persijos įlankos karo 1991 Norėdami apsaugoti Kuveitas iš Irako invazijos ir vairuoti irakiečius iš Kuveito, karinis koalicija, vadovaujama JAV siuntė pajėgas į Saudo Arabiją. Iš Saudo vyriausybės sprendimas leisti JAV karių Saudo Arabijoje, kur švenčiausių musulmonų sklypai, prieštaravo bin Ladeną. Bin Ladenas ir Al-Qaida "radikaliai išplėtė savo tikslus po Persijos įlankos karo 1991 Jie reikalavo, kad užsienio įtaka turėtų būti pašalintas iš musulmoniškų šalių. Bin Ladenas veikla prieš Saudo Arabijos vyriausybei priversti jį rasti pastogę Už Saudo Arabija. Jis gyveno Sudane nuo 1991 iki 1996, kai jis buvo pašalintas iš Sudano vyriausybė, kurie buvo spaudžiami JAV ir Saudo Arabija. Tada jis perėjo bazę Afganistane, kur jis gyveno saugomos Talibanu, kuris buvo konservatyvi Islamo grupė, kuri turėjo kontroliuoti dauguma toje šalyje.
JAV ir sąjungininkų pajėgos ir toliau ieškoti bin Ladeno ir kiti Qaida lyderiai po Talibano žlugimo. Nors daugelis iš lyderių buvo perimta arba nužudyti, kiti lyderiai, įskaitant bin Ladenu, vis dar išlieka didelis. Manoma, kad JAV ir kitų pareigūnų, kad Bin Ladenas yra slepiasi palei Afganistano ir Pakistano pasienio regione. Nuo 2001, iš garso ir vaizdo pareiškimų priskirtų bin Ladeno skaičius buvo eteryje arabų transliavimo stočių, ypač "Al-Jazeera.