Vasario 24, 1868, kongresmenas Stivenso inicijavo apkaltos -proceedings prieš prezidentą aukštos nusikaltimus ir baudžiamuosius nusižengimus. Tyrimas truko du mėnesius. Pabaigoje, galutinis balsavimas Senate buvo 35 įsitikinimu, 19 "prieš". Kadangi dviejų trečdalių balsų dauguma buvo reikalaujama, jis buvo gailima vieno balsavimo. Nors išteisintas, "Johnson patiekiamas savo kadenciją kaip bejėgiai pirmininku ir tapo ne rimtas bandymas už 1868 Prezidento nominacijoje. Jis buvo pakeistos Ulysses S. Grant, respublikonas.
Johnsonas administracija, tačiau buvo ne be nemažų laimėjimų užsienio politikoje. Johnsonas, sumaniai padeda valstybės sekretorius William H. Seward, pavyko gauti Prancūzijos pasitraukti iš Meksikos 1867, taip puoselėjant Monro doktrina. Seward pat deramasi Aliaskos pirkimo iš Rusijos, kad tais pačiais metais.
Paskutiniais metais
pasitraukus iš pareigų, "Johnson grįžo į Tenesis, kur jis vyko aktyviai domisi valstybės politikoje. 1869 jis buvo nesėkmingas kandidatas į JAV Senatą ir 1872 jis buvo nugalėta atstovas-AT-didelis iš Tenesio Kongresui. Jis vėl bėgo Senato 1874, ir buvo išrinktas šį kartą. Kai jis grįžo į Senato kovo, 1875, jis gavo nuolatinį plojimai. Netrukus po Kongresas atidėjo tą vasarą, "Johnson aplankė į Carter apskritis, Tenesis, kur jis patyrė insultą ir mirė liepos 31 dukterį
Johnsonas buvo palaidotas ant kalvos į Greeneville, suvynioti į 37-žvaigždučių vėliava su Konstitucijos kopija pagal jo galvos.
