Lewis ir Clark ekspedicija
1803 Jefferson pavadino savo asmeniniu sekretoriumi bei su jais bendradarbiaujančių Virdžinijos, 29- metų Meriwether Lewisas, kaip Vakarų ekspedicijos vadas [šaltinis: University of Virginia]. Lewisas (1774-1809), gabus ir patyręs snaiperis lauko darbus, tarnavo kaip kariuomenės vadas Šiaurės Vakarų teritorijos. Jis pasirinko William Clark (1770-1838), iš armijos draugas, kaip ir jo bendrą kapitonas. Lewisas manė, kad Clark turėjo tinkamą pusiausvyrą fizinės jėgos ir intelekto padėti vadovauti įgulos neatrastų atradimų kelionė - ir jis taip pat turėjo reputaciją kaip žemėlapių kūrimo priemone, todėl jis tapo oficialiu kartografas partijos. Jo galutinis žemėlapis Lewis ir Clark Trail yra tiksli per 40 mylių, nors ji aprėpia 8000 mylių
jo galutinio nurodymus tyrinėtojų, Jefferson pareiškė, kad ". <...> Jūsų misija objektas ištirti Misūrio upės ir tokias pagrindines sroves jį pagal savo kursą ir ryšių su Kolumbijos, Oregon, Colorado ar bet kurioje kitoje upės vandenų, gali pasiūlyti labiausiai tiesioginis ir įmanoma vandens komunikuoti šiame žemyne dėl komercijos " tikslais; [Šaltinis: National Park Service].
Tiesioginis vandens maršrutas nuo jūros iki jūros galėjo Jefferson pagrindinis tikslas, tačiau tai buvo ne tik jo tikslas ekspedicijos. Jefferson, kaip ir visi Apšvietos mąstytojai, norėjau naudoti mokslas formuoti ekspediciją. Jis papasakojo tyrinėtojai rinkti, klasifikuoti, dokumentų ir stebėti kraštovaizdį, jo gyvūniją ir žmones su mokslo tikslumo. Štai kodėl yra tokia informacijos apie kelionę gausa -. Dauguma narių laikomi žurnalus, paėmė išsamias pastabas ir prijungti prie vietovės, kaip jie nuėjo į priekį
Kadangi ekspedicija įgula greičiausiai būtų veikia į JAV Indijos gentys savo kelionę, Jefferson taip pat norėjo, kad jie būtų laisvai gestų kalbos niuansų, diplomatijos ritualų ir subtilių simbolių karinės galios. Vyrai turėjo mokytis ant socialinių papročių skirtingų genčių -. Jie turėjo