Kryžiaus žygiai, prasidėję 1096, atnešė Romos katalikų armijos iš Vakarų Europos žygiavimas visoje Rytų Ortodoksas šalių Balkanų kelyje į Šventąją Žemę. Priešiškumas tarp kryžiuočių ir vietinių gyventojų nuolat augo. 1204 Ketvirtas žygis, privalo iš pradžių Egiptą, o perimta Konstantinopolis (Stambulo) ir perėmė daug Bizantijos imperijos, kuri buvo pervadinta Lotynų imperija (už Lotynų apeigų Romos bažnyčios). Kryžiuočių narės buvo įkurtas Graikijos ir Egėjo jūros galvos, o miestas-valstybė Venecijos užima kelis uostus Adrijos jūros.
Su Bizantijos žlugimo, antras Bulgarų imperija buvo įkurta ir Serbija tapo nepriklausoma karalyste. Bizantija buvo atstatyta 1261, bet ji neturėjo savo buvusį stiprumą. Serbija įrašytos į plėtimosi laikotarpiu ir viduryje 1300 s sukūrė didelę imperiją. Bosnija, plėsti tuo pačiu laikotarpiu, pridedamas kaimyninių Hercegovinoje. Vengrija išsiplėtė į pietus.
1354 Osmanų imperija, kurie jau užkariavo didžiąją dalį Mažosios Azijos, kirto į Balkanus. Bizantija nukrito į juos 1453, ir pradžioje 16 amžiaus beveik visa pusiasalis buvo užkariauta.
Šiuolaikinio laikotarpio
Po jo labai eros užkariavimo ir plėtrą, Osmanų imperija palaipsniui sumažėjo energingai. Austrija ir Rusija buvo tiek išlenktas dėl teritorinės naudos ir venecijiečių norėjo atkurti savo prekybos kelius. Osmanai dažnai buvo ne karo su viena ar daugiau šių galių ir 1700 pradėjo prarasti teritoriją Balkanuose. Karai tęstinio per 18 ir 19 amžių lėmė tolesnių nuostolių. Graikija buvo pirmasis įgyti nepriklausomybę, 1832 metais, ir iki šio amžiaus pabaigos dauguma kitų Balkanų šalių laimėjo savo nepriklausomybę taip pat.
dvi Balkanų karai, 1912-13, likviduojamas turkų valstybę Europoje išskyrus regiono aplink Konstantinopolio. Austrijos-Vengrijos imperijos vyks teritoriją į šiaurės vakarus, tačiau Rusija nesugebėjo prasiskverbti į Balkanus. Pasipiktinimas prieš Austriją buvo incidento, kad nusodinti I pasaulinio karo metu, kuris atnešė į pabaigą Austrijos-Vengrijos imperijos priežastis. Naujas tauta, serbų, kroatų, slovėnų ir karalystė, buvo sukurtas; vėliau ji buvo pervadinta Jugoslaviją.
Balkanų Antantė, vadovaujama Prancūzijos, buvo surengta 1934 m stengiantis išvengti vokiečių skverbimąsi į Balkanus. Rumunija, Jugoslavija, Graikija, Turkija ir buvo prisijungę. Agresyvus Vokietijos prekybos politikos ir diplomatinės pastangos per 1930-ųjų, tačiau sudaužė Antantės, o per II pasaulinį karą Bulgari
